О страх! Скуби-Ду и его экипаж были до гроба напуганы, когда отправились в страшный круиз в одно из наиболее загадочных мест на берегу - знаментый Бермудский треугольник! Друзей пугают на каждом шагу - то пришельцы, то ужасные Пираты-Духи, которым нравится стрелять в круизные корабли из орудий и топить их.
Дела становятся все хуже, когда Пираты-Духи крадут родителей Фреда и превращают его маму в пирата. Если Скуби-Ду, Шегги и экипаж не разгадают эту водную тайну, их могут сбросить за корму, и они станут следующими жертвами Треугольника!
Тут создают наиболее совершенных Героев. Их миссия - защищать вселенную от зла. Во главе группы Альфа стоит отважный лидер Стормер, за ним следуют мастера собственного дела Балк и Стрингер, и новобранцы Фурно, Бриз и Сурж.
Они сражаются с такими страшными монстрами, как ядовитый Корродер, вооруженный вращающимися клинками Ротор, и импульсивный снайпер Эксплод. Однако эти негодяи работают не одни. Герой-отступник из предыдущего Стормера желает ликвидировать Фабрику Героев и погрузить всю гал-ку в хаос. Для того чтоб остановить его, Героям потребуются все их силы, смекалка и отвага.
После приключений под землей прошло 7 лет. Случился дрейф континентов. Главные герои мультфильма, отделённые от стада, вынуждены применять айсберг в качестве плота. Они пересекают океан и попадают в неизвестные им раньше земли с экзотическими животными и пиратами, враждебно настроенными к ним. Скрэту удаётся получить собственный жёлудь, однако он перемещается в новенькие для него земли.
Неугомонная курица Лифи оставляет уютную сытую жизнь на птицефабрике и отправляется в лес. Волей случая она спасает маленького утенка от лисицы и берет его под свое крыло. Опасные и веселые приключения ожидают эту странную парочку.
